在浩瀚的宇宙中，有一个名叫库克斯的美丽星球，这个星球是一个自然环境与人文建筑融为一体的绿色星球。但是即使是这样的星球也曾有过不堪回首的往事，三百六十年前，库克斯是一个环保意识薄弱，只顾工业生产的星球，到处是煤烟四起的工厂,天空飘着黑色的阴霾,隐约能看到一丝阳光。曾经被宇宙联盟击溃的毁灭者，死灰复燃，他们看上了库克斯的污染环境：对于一个长期漂浮在宇宙中的种族来说，这绝对是一个非常适合它们生长的星球。于是他们向库克斯发出进攻。库克斯希望启用元素粒子聚合反应炮来抵御这场来势凶猛的进攻，可是聚合反应炮的能量紧缺，根本不足以抵御毁灭者的进攻。于是，库克斯决定重启曾经废弃的探质计划，派出库克斯最后的希望——探质三号，去宇宙中寻找另一种元素，来替代紧缺的能量，并捍卫库克斯乃至整个宇宙联盟。最终，探质三号成功完成任务。