出身于围棋世家的江南少年林清平赴京寻父，路上巧遇大臣，两人因棋结为莫逆。大臣和林清平也因棋而帮助苏州县令破获两起命案。两人分别时，大臣命其家中侍卫女扮男装的薛叮当护佑林清平上京。一路上，林清平以棋化敌，几经波折与磨难，结识了围棋才俊沈毅雄以及他的5个号称江南五手的搞笑徒弟；获得了懿云公主的纯真爱情；与父亲旧友大国手酒和尚对弈；在红杏谷中得到还阳婆婆的洞中真传而棋力大增。来到京城后，林清平在弈林大赛上力克群雄拔得头筹，又以大国手身份对弈前来挑战外国围棋高手，大获全胜。之后在与先皇驸马、大国手刘木溪的切磋中，林清平发现他正是自己苦苦寻找的父亲。经历一番周折，林清平与懿云公主完婚，乾隆皇帝御赐林清平为少年棋圣之称号。