Michael发现自己的老情人Cassandra有危险。Michael当年奉「组织」的命令假意亲近Cassandra，尽管两人没有真实感情，但Michael对她还是有所牵挂。更重要的是，Michael心中一直有负罪感。当他向Nikita提出去帮助Cassandra时，Nikita起了疑心--或许他们的关系并不像Michael所说的那样简单?最后Nikita在与Cassandra的儿子Max交流时发现Max真正的年龄是5岁多一点，正好是Michael离开Cassandra的9个月后。并通过Cassandra证实Michael是小Max的亲生父亲。Cassandra坦言不想让Michael知道实情，担心[组织]的[赶尽杀绝]。.Cassandra希望Nikita为此事保密。与此同时，Amanda诱使Alex协助她进行一项任务。Sean发现自己陷进了Amanda编织的谎言之网，不禁开始怀疑「组织」存在的真实目的。
在查阅黑盒子里的信息时，Birkhoff偶然发现了Nikita的出生证明。Nikita决定和Michael一起寻找自己的生父Richard，但父女团聚时的情形却和Nikita预想的不一样。与此同时，Percy告诉Alex--Nikita手中的黑盒子里储存着能够帮助Alex报杀父之仇的重要信息。
监狱中的Ryan偶然发现了「监督部」的资金来源方式。Ryan偷偷找来Nikita，将这一重要线索提供给她。Amanda截获了两人的加密信息，及时通知「监督部」做好防范。「监督部」派专人前来审讯Ryan，Nikita和Michael决定在「监督部」对Ryan动手之前将他从监狱里劫走。与此同时，Alex遭到Gogol特工的追踪，被迫面对过去的某个人。
Michael听说Cassandra有难，立刻赶过去帮助她。他发现Tupelov将军指控Cassandra偷了两百万美元，并威胁要杀死Cassandra。Nikita发现Cassandra的话漏洞百出，怀疑她可能隐藏了一些事情。与此同时，Percy向Alex提出一个诱人的条件：他可以帮她永远铲除Semak。
Nikita偷窃了「监督部」的资金，迫使「监督部」召开紧急会议。Nikita和Birkhoff决心用一切手段来监视此次会议，以便查清「监督部」其他高级成员的真实身份。但事情的进展并不顺利，Birkhoff落入Sean手中。Amanda要求Birkhoff说出Nikita的下落，但Birkhoff不肯开口，于是Amanda开始用酷刑折磨Birkhoff。与此同时，Alex继续推进重建父亲的帝国的计划。Alex明白Gogol在悬赏捉拿她，但她也明白了另一件事：要想神不知鬼不觉地返回俄罗斯，就必须采用她离开时所用过的方法--非法性奴偷运。
Michael不在身边，Nikita只好求助于Owen来帮她追踪另一名守护者并盗取其手中的黑盒子。她很快发现Owen在为危险的Gogol组织卖命，很有可能破坏她的行动计划。与此同时，Amanda意识到Alex已经掌握了Semak的秘密情报，而那些情报只可能来源于Percy。怒火中烧的Amanda决定给Percy一个教训--剥夺他所有的「特权」和娱乐设施。逗留在俄罗斯的Alex终于开始对Semak采取行动。
