正在北京开会的万书记，果然打电话给洪市长，责问公安局为什么要查这个案。洪市长将此情况告诉林荫，并要他尽快突破。
林荫调兵遣将，加强了在兴旺村的调查力量，村民纷纷开始举报，提供线索和证据。薛怀礼和李大兴的犯罪证据越来越多。林荫决定传唤薛、李，但他们却在郑光军安排下匆忙逃离。这一切都说明薛、李有重大犯罪嫌疑，而徐子民是无辜的。
徐子民一恢复自由就控告薛怀礼、李大兴，还告牛明、赵铁军刑讯逼供。调查开始后，虽然牛明、赵铁军不承认，但造成错案却是事实，所以尽管牛明将责任推到罗厚平和赵铁军身上，让罗受了处分，但他仍负有不可推卸的领导责任。万书记大为恼火，取消了对牛明的提拔。在这次较量中，林荫占了上风，但他也意识到，对方不会善罢甘休。
林荫到地区公安局汇报工作，谷局长提醒他要把困难想得多一点，又劝林荫抓紧把家搬到清水，不然秀云会有意见。谷局长还问了清水公安局的经费问题，甚至苗雨的情况。林荫一一做了说明。谷局长听后，嘱咐林荫大胆工作，无论遇到什么困难，都要坚定信念。林荫有了一种不祥的预感……
果然，刚回到清水，洪市长便找林荫和方政委谈话，告诉他们由地区政法委和纪检委组成的联合调查组将来清水，调查清水公安局的问题，也就是林荫的问题。何大来是调查组副组长。
林、方二人虽感突然，但他们表示一定认真接受调查，不会因此影响工作。
郑光军和牛明对调查组的到来欢欣鼓舞，在皇朝大酒店拉着陶素素举杯相庆。牛明又担心在这关键时刻，薛怀礼、李大兴再出麻烦。郑说不必担心，这两人已去了广州。
调查组的到来令全局干警心情沉重，气氛也变得压抑起来。秦志剑愤愤不平，来找林荫，说这工作没法干了。林荫告诫他不可这样消极，影响工作，并透露昨晚有一女人打来匿名电话，提供了重要线索——薛、李二人在广州，要求秦尽快查实……
郝正很兴奋，在一些办公室串来串去，想拉人们谈这个事，但大家都小心回避着这个问题。
地区调查组分别与局领导班子成员，和科室队负责人乃至一般干警谈话，就是没找林荫谈。方政委和靳树林告诉林荫他们与调查组谈话的主要内容：对市委说过不满的话，到省财政厅要钱，给高翔等编外人员发补助费等等。秦志剑也来了，说调查组也找他谈话了，内容与方政委谈的差不多，但秦志剑说调查组还问林荫作风问题，虽未明说，但听得出来，是指林荫与苗雨的关系不正常。林荫又惊又怒……
报社主编提醒苗雨调查组也会向她调查与林荫的关系，苗雨觉得十分可笑……
秀云接到一个说林荫出问题的匿名电话，她匆匆赶到清水，劝林荫离开清水。林荫觉得自己不应该再沉默了，他拿起电话，找何大来，要与调查组谈……
在调查组驻的宾馆里，林荫与何大来激烈舌战，有理有据，逐一驳斥何大来对他的指控，澄清了事实，赢得调查组组长、地委纪检委毛主任的理解。
在公安局里，方政委、秦志剑等人牵挂着林荫，商量对策。方政委表示如果林荫被整走，自己也不干了。
苗雨直闯调查组，坦陈自己的看法，大出何大来的预料……
郑光军以为林荫这次肯定垮台，便召集手下在华光集团总部开会，指示手下抓住这一大好时间，加大力度，完成收入指标，还要催收世纪工程捐款。大秃子不服他的指令，认为难以完成，争执起来。郑光军起了杀心。
调查组返回白山，组长毛主任认为根据调查的事实，林荫的言行没有重大错误，有些所谓的问题都是捕风捉影，必须对林荫做出正确的评价。何大来理屈词穷，无可奈何……
大秃子不服郑光军，打算摆脱郑的控制，独立单干。郑光军却抢先一步，暗中召回郑华军，将大秃子杀死在荒郊野外。郑光军组织中的这一变动，很快被秦志剑、黄建强等人发觉，但又缺乏证据，林荫只能要求刑警大队加强监视，继续挖掘线索
摊派给个体司机的世纪工程捐款，迟迟收不上来，万书记十分恼火。郑光军约来交通局长蒋实全，密谋联手强制收款，从中牟取利益……
林荫突然接到电话，靳树林报告： 个体出租车司机驾车驶向市委和市政府大楼，将市委大楼团团围住。
根据初步调查，事件的起因是郑光军的手下在路上设卡收捐款，老杨父子交不出，又被打得头破血流。司机们终于忍不住，聚在一起商量对策，决定到市委反映情况。
林荫在局里部署好各项应急措施，为了不激化矛盾，他只派出便衣警力暗中控制现场，保护市委和市政府，然后他和方政委赶去市政府开紧急会议。
市政府会议室里，万书记召集会议，大发雷霆， 蒋实全将责任推到公安局，说抓几个人就行了。林荫和苏检察长驳斥了他的说法。林荫坚持认为司机们闹事是事出有因，不同意采取强硬措施，建议以对话的方式解决问题。他的意见引起万书记和于海荣的不满，但洪市长表示支持。会议最终采纳了林荫的意见，他也成为对话组的一员，负责与司机代表对话。
